私立アキハバラ学園

転校を機にオタクを卒業しようとする主人公、冬馬壮一郎。
しかし、義理の妹の琴未の策略により、アキハバラにある私立アキハバラ学園に転校する事になる。
そこは主人公よりさらに濃い様々なオタクが集まる学園だった。
校内ではメイドが案内してくれ、学園長は等身大フィギアを抱いている。
そして主人公は美少女ゲームシナリオコースに編入が決まってしまう。
同じく転校してきた麻里子はオタク嫌いのふつうの女の子で、何かと主人公に絡んでくる担任は子供のような容姿のなみ先生。
案の定クラスメイトはオタクだらけ。
主人公はとまどいつつも学園生活を始めるのだった。